Учредитель АзМИ — Тентишев Эркин Саткынбаевич
Ректор института – заслуженный врач Кыргызской Республики,доктор медицинских наук , профессор Сельпиев Тойчубек Тулекович
Проректор по международным связям, кандидат филологических наук- Ысакулов Кутбидин Ысакулович
Проректор по учебной и научной работе- кандидат медицинских наук — Кушбакеева Аписа Кушбакеевна
Проректор по качеству образования и трудовой дисциплине- Эдигеев Жанат Асылбекович
Проректор по воспитательной работе- Мишра Прашант Ранжан
Ученый секретарь – кандидат медицинских наук старший научный сотрудник Доскеева Евгения Амановна
Начальник учебно-методического отдела, магистр- Бикбулатова Сафина Рифовна
Декан лечебного факультета – магистр Качиева Шахриза Саткыновна